Mongolianmaksaruoho muodostaa monivuotisia, mattomaisia, 10–25 cm korkeita kasvustoja. Varsi on tyvestä paksu, puutunut ja koheneva. Lehdet ovat vihreitä ja ryhmittyvät hyvin tiheästi versojen latvaan. Ne ovat vastapuikeita, tylppähampaisia ja 2–3 cm pitkiä ja sijaitsevat kierteisesti (yksi kussakin nivelessä).

Mongolianmaksaruoho kukkii heinä–elokuussa. Sen kukinto on päätteinen harsu viuhko, jonka kukkien terälehdet ovat 8–10 mm pitkiä ja keltaisia. Verhiössä ja teriössä on viisi lehteä. Verholehdet ovat tylppiä ja hiukan terälehtiä lyhyempiä.

Mongolianmaksaruohon erottaa toisesta Suomessa mahdollisesti haitallisesta maksaruohosta, kaukasianmaksaruohosta (Phedimus spurius), lehtiasennosta ja kukan väristä. Mongolianmaksaruohosta poiketen kaukasianmaksaruohon lehdet sijaitsevat varrella vastakkain ja sen kukinto on tavallisesti vaaleanpunainen.

Suomen luonnonvaraisista maksaruohoista keltamaksaruoholla (Sedum acre) ja särmämaksaruoholla (Sedum sexangulare) on keltaiset kukinnot, jotka ovat kuitenkin pienemmät kuin mongolianmaksaruoholla. Myös niiden lehdet ovat huomattavasti pienemmät ja muodoltaan lieriömäiset eli poikkileikkaukseltaan pyöreät.

Phedimus hybridus