Metsäomenapuu kasvaa tavallisesti 3-8 (10) metrin korkuiseksi. Sen runko on tumman harmaanruskea ja se on nuorena sileä, vanhemmiten kookkaiksi suomuiksi liuskoittuva. Osa metsäomenapuun haaroista kehittyy oraiksi.

Metsäomenapuun lehdet ovat 3-8 cm pitkät. Ne ovat muodoltaan puikeat, hammaslaitaiset ja lyhytkärkiset. Lehtilapa on yläpinnaltaan tummanvihreä ja kalju, alapinnaltaan vaaleampi.

Hyönteispölytteinen metsäomenapuu kukkii alkukesällä, touko-kesäkuussa. Sen valkoiset-vaaleanpunertavat kaksineuvoiset kukat ovat 3-4 cm leveät. Kukat kasvavat oksien lyhyisiin sivuhaaroihin ja ovat 2-6 kukan sarjoina. Pölyttyneestä kukasta kehittyy pallomainen hedelmä, omena. Hedelmä on kypsänä 1-2 cm pitkä ja väriltää kellanvihreä.

Metsäomenapuu risteytyy helposti tarhaomenapuun (Malus domestica) kanssa.

Aplar – Malus