Kääpiökerttu pesii Keski-Aasiassa, Kaspianmeren pohjois- ja itärannikolta Kiinan ja Mongolian keskiosiin ulottuvalla alueella, ja talvehtii Lähi-idässä sekä Koillis-Afrikassa. Pesimäympäristöä ovat puoliaavikot, aavikot ja arot (BirdLife International 2019). Kääpiökerttu on Suomessa suurharvinaisuus, joka on havaittu maassamme 14 kertaa vuoden 2023 loppuun mennessä. Kymmenen yksilöä on löytynyt lokakuussa, kaksi marraskuussa, yksi toukokuussa ja yksi kesäkuussa. Kuusi syksyistä lintua on viihtynyt löytöpaikalla useamman päivän (BirdLife Suomi 2024).

Kääpiökerttu on havaittu Haliaksella kahdesti. Ensimmäinen yksilö löytyi 22.10.2005 Gåsörsbergetin rantakallion tuntumasta (Lindholm ym. 2006). Aseman toinen yksilö löytyi puolestaan Gåsörsuddenin särkän pensaikosta 17.10.2017. Lintu viihtyi paikalla useamman päivän, ja se rengastettiin 20.10 (Väisänen ym. 2017).

Kääpiökerttu – Curruca nana